Ο Τζόναθαν Γκόμες είναι και επίσημα παίκτης του ΠΑΟΚ, καθώς ανακοινώθηκε από την ΠΑΕ. Από την πλευρά της, ανακοίνωση εξέδωσε και η πρώην ομάδα του, Ρεάλ Σοσιεδάδ, η οποία τονίζει ότι διατηρεί το δικαίωμα να εισπράξει ποσοστό μεταπώλησης σε μελλοντικό χρόνο και εφόσον ο ΠΑΟΚ πουλήσει τα δικαιώματα του νεαρού.
Συγκεκριμένα, η ισπανική ομάδα αναφέρει:
«Ρεάλ Σοσιεδάδ και ΠΑΟΚ κατέληξαν σε συμφωνία για τη μεταγραφή του Τζόναθαν Γκόμεζ στον ελληνικό σύλλογο. Η Ρεάλ Σοσιεδάδ θα ήθελε να ευχαριστήσει τον Jonathan για την προσπάθεια και την αφοσίωσή του στο διάστημα που ανήκε στον σύλλογο και του εύχεται τα καλύτερα για το προσωπικό και επαγγελματικό του μέλλον. Η Ρεάλ Σοσιεδάδ διατηρεί το δικαίωμα επιστροφής από μια πιθανή μελλοντική μεταγραφή».