H κλήρωση της δεύτερης φάσης του κυπέλλου Ελλάδας με τη συμμετοχή ομάδων που κατέκτησαν το κύπελλο στις ΕΠΣ θα γίνει την Πέμπτη ενώ τα παιχνίδια θα διεξαχθούν στις 21 Σεπτεμβρίου.
Στην τρίτη φάση θα μπουν στην κληρωτίδα και οι ομάδες της Σούπερ Λιγκ 2